Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
INTS9Q9NV88 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
INTS9Q9NV88 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
INTS9Q9NV88 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms