Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDP1Q9NUW8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TDP1Q9NUW8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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