Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZCCHC3Q9NUD5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZCCHC3Q9NUD5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms