Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMC4Q9NTJ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC4Q9NTJ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC4Q9NTJ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC4Q9NTJ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC4Q9NTJ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC4Q9NTJ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC4Q9NTJ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC4Q9NTJ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMC4Q9NTJ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMC4Q9NTJ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms