Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC38.76■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
PDS5BQ9NTI5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
PDS5BQ9NTI5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
PDS5BQ9NTI5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms