Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC6A13Q9NSD5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC6A13Q9NSD5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms