Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM7SF3Q9NS93 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM7SF3Q9NS93 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms