Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KCNIP2Q9NS61 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KCNIP2Q9NS61 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms