Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS45Q9NRW7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS45Q9NRW7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms