Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TLR9Q9NR96 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TLR9Q9NR96 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms