Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 LINC00470-201ENST00000412816 2031 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.087e-7■■■■■ 27.9
EXOSC5Q9NQT4 LINC00470-207ENST00000581430 556 ntTSL 56.29□□□□□ -1.47e-7■■■■■ 27.9
EXOSC5Q9NQT4 CCDC91-218ENST00000544649 665 ntTSL 314.64□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 27.9
EXOSC5Q9NQT4 CCDC91-206ENST00000538586 471 ntTSL 46.32□□□□□ -1.43e-7■■■■■ 27.9
EXOSC5Q9NQT4 CCDC91-216ENST00000543534 575 ntTSL 55.21□□□□□ -1.583e-7■■■■■ 27.9
EXOSC5Q9NQT4 GPR89A-202ENST00000460277 1955 ntTSL 1 (best)14.65□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 GPR89A-201ENST00000313835 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.065e-7■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 GPR89A-204ENST00000465185 1906 ntTSL 27.78□□□□□ -1.165e-7■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 GPR89A-208ENST00000493684 2699 ntTSL 27.08□□□□□ -1.285e-7■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.545e-7■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.65e-7■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 GPR89A-206ENST00000478703 662 ntTSL 53.19□□□□□ -1.95e-7■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF720-206ENST00000530881 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.5□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF720-207ENST00000531864 1670 ntTSL 212.01□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF720-201ENST00000316491 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF720-209ENST00000534277 5994 ntTSL 1 (best)6.63□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF720-212ENST00000542684 481 ntTSL 36.56□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF720-213ENST00000544044 572 ntTSL 56.26□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF720-203ENST00000398707 2282 ntTSL 26.11□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF720-205ENST00000529943 1214 ntTSL 25.7□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF720-208ENST00000533488 639 ntTSL 34.7□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF720-204ENST00000529515 518 ntAPPRIS ALT2 TSL 34.7□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 27.8
EXOSC5Q9NQT4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.559e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 CPEB1-205ENST00000569257 527 ntTSL 417.33■□□□□ 0.369e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 CPEB1-203ENST00000567678 557 ntTSL 415.65■□□□□ 0.19e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.229e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 CPEB1-215ENST00000617958 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.99e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 CPEB1-207ENST00000611031 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -19e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 CPEB1-209ENST00000614918 4882 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.169e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.347e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 RBM41-208ENST00000495517 3315 ntTSL 26.05□□□□□ -1.447e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.487e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 RBM41-203ENST00000434854 680 ntTSL 54.04□□□□□ -1.767e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 APBA2-209ENST00000559709 594 ntTSL 418.93■□□□□ 0.625e-8■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 APBA2-210ENST00000559814 2555 ntTSL 1 (best)16.84■□□□□ 0.295e-8■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.015e-8■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.215e-8■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.525e-8■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.75e-8■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.785e-8■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 APBA2-208ENST00000558804 535 ntTSL 49.95□□□□□ -0.825e-8■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 TEX10-201ENST00000374902 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 TEX10-204ENST00000535814 3006 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 STRN3-207ENST00000555358 2208 ntTSL 1 (best)20.71■□□□□ 0.917e-8■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.644e-9■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 AC004980.1-202ENST00000450661 962 ntTSL 1 (best)18.54■□□□□ 0.564e-9■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.527e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 AC004980.1-203ENST00000423084 748 ntTSL 317.98■□□□□ 0.474e-9■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.27e-8■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 LRRC8C-203ENST00000479252 2993 ntTSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.237e-8■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 LRRC8C-204ENST00000482063 504 ntTSL 312.31□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.587e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 KDM2A-201ENST00000308783 3666 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 KDM2A-208ENST00000527157 574 ntTSL 23.5□□□□□ -1.857e-7■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -22e-6■■■■■ 27.7
EXOSC5Q9NQT4 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 PRR4-214ENST00000546317 281 ntTSL 54.15□□□□□ -1.751e-6■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 SLC25A21-205ENST00000557611 591 ntTSL 510.71□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 SLC25A21-201ENST00000331299 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D15-216ENST00000549402 593 ntTSL 513.76□□□□□ -0.216e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D15-211ENST00000491063 1223 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.216e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D15-208ENST00000482439 863 ntTSL 511.85□□□□□ -0.516e-7■■■■■ 27.6
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EXOSC5Q9NQT4 TBC1D15-214ENST00000546932 557 ntTSL 411.13□□□□□ -0.636e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D15-212ENST00000498482 566 ntTSL 410.11□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D15-205ENST00000472611 640 ntTSL 310.11□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D15-217ENST00000550746 6184 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.596e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D15-203ENST00000462788 1995 ntTSL 1 (best)3.95□□□□□ -1.786e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.926e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 TBC1D15-204ENST00000468049 363 ntTSL 52.99□□□□□ -1.936e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 AC087633.2-203ENST00000618377 489 ntTSL 516.9■□□□□ 0.33e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 AC087633.2-204ENST00000621842 496 ntTSL 58.33□□□□□ -1.083e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 AC087633.2-206ENST00000614581 513 ntTSL 55.88□□□□□ -1.473e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 AC087633.2-205ENST00000615751 500 ntTSL 55.74□□□□□ -1.493e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.63e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 SYNJ2-206ENST00000485863 810 ntTSL 314.94□□□□□ -0.024e-11■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.584e-11■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 SPTBN1-203ENST00000389980 2164 ntTSL 1 (best)10.34□□□□□ -0.755e-6■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.844e-11■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 SYNJ2-207ENST00000638626 7332 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.924e-11■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.085e-6■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 LMBR1-213ENST00000454132 2922 ntTSL 217.3■□□□□ 0.369e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 LMBR1-210ENST00000434503 930 ntTSL 516.55■□□□□ 0.249e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.019e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.419e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 LMBR1-204ENST00000415428 3457 ntTSL 1 (best)5.27□□□□□ -1.579e-7■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 BRWD3-203ENST00000478415 1350 ntTSL 513.49□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 27.6
EXOSC5Q9NQT4 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 27.6
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