Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CBX8Q9HC52 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX8Q9HC52 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX8Q9HC52 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms