Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PARVBQ9HBI1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PARVBQ9HBI1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms