Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UPF2Q9HAU5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UPF2Q9HAU5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms