Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VIPAS39Q9H9C1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIPAS39Q9H9C1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VIPAS39Q9H9C1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms