Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C8orf33Q9H7E9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C8orf33Q9H7E9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms