Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SH2D4AQ9H788 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SH2D4AQ9H788 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms