Protein–RNA interactions for Protein: Q9H444

CHMP4B, Charged multivesicular body protein 4b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BQ9H444 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHMP4BQ9H444 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHMP4BQ9H444 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms