Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRRN3Q9H3W5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRN3Q9H3W5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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