Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF39Q9H2S5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF39Q9H2S5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms