Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EHD4Q9H223 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms