Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y0

ATG5, Autophagy protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG5Q9H1Y0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATG5Q9H1Y0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATG5Q9H1Y0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms