Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMX4Q9H1E5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMX4Q9H1E5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMX4Q9H1E5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMX4Q9H1E5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMX4Q9H1E5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMX4Q9H1E5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMX4Q9H1E5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMX4Q9H1E5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms