Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MTMR12Q9C0I1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTMR12Q9C0I1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MTMR12Q9C0I1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms