Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ASXL3Q9C0F0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASXL3Q9C0F0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASXL3Q9C0F0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms