Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CIPCQ9C0C6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CIPCQ9C0C6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms