Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ROPN1BQ9BZX4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms