Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HDAC8Q9BY41 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDAC8Q9BY41 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms