Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
KATNB1Q9BVA0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KATNB1Q9BVA0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms