Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHCHD7Q9BUK0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHCHD7Q9BUK0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms