Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NDC1Q9BTX1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NDC1Q9BTX1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms