Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NDFIP1Q9BT67 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDFIP1Q9BT67 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDFIP1Q9BT67 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDFIP1Q9BT67 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDFIP1Q9BT67 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDFIP1Q9BT67 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDFIP1Q9BT67 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms