Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRACR2AQ9BSW2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRACR2AQ9BSW2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms