Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00467Q9BRT7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00467Q9BRT7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms