Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEC22CQ9BRL7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC22CQ9BRL7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms