Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LYSTQ99698 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms