Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PITX2Q99697 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PITX2Q99697 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms