Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
POP1Q99575 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP1Q99575 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP1Q99575 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP1Q99575 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POP1Q99575 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP1Q99575 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP1Q99575 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP1Q99575 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP1Q99575 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP1Q99575 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP1Q99575 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP1Q99575 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP1Q99575 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP1Q99575 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP1Q99575 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP1Q99575 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP1Q99575 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POP1Q99575 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POP1Q99575 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POP1Q99575 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POP1Q99575 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POP1Q99575 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POP1Q99575 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POP1Q99575 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POP1Q99575 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POP1Q99575 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POP1Q99575 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POP1Q99575 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POP1Q99575 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
POP1Q99575 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
POP1Q99575 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POP1Q99575 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POP1Q99575 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POP1Q99575 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
POP1Q99575 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POP1Q99575 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POP1Q99575 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POP1Q99575 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POP1Q99575 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POP1Q99575 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POP1Q99575 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POP1Q99575 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
POP1Q99575 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POP1Q99575 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP1Q99575 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP1Q99575 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP1Q99575 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP1Q99575 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP1Q99575 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP1Q99575 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP1Q99575 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP1Q99575 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP1Q99575 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP1Q99575 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
POP1Q99575 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP1Q99575 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
POP1Q99575 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP1Q99575 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP1Q99575 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP1Q99575 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP1Q99575 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP1Q99575 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP1Q99575 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP1Q99575 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP1Q99575 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP1Q99575 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP1Q99575 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP1Q99575 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POP1Q99575 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POP1Q99575 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POP1Q99575 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POP1Q99575 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POP1Q99575 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POP1Q99575 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POP1Q99575 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
POP1Q99575 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POP1Q99575 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POP1Q99575 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POP1Q99575 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POP1Q99575 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POP1Q99575 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
POP1Q99575 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POP1Q99575 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POP1Q99575 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POP1Q99575 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POP1Q99575 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POP1Q99575 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POP1Q99575 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POP1Q99575 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POP1Q99575 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POP1Q99575 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POP1Q99575 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POP1Q99575 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POP1Q99575 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POP1Q99575 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POP1Q99575 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
POP1Q99575 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
POP1Q99575 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POP1Q99575 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms