Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP4Q99569 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP4Q99569 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP4Q99569 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP4Q99569 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP4Q99569 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PKP4Q99569 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKP4Q99569 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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