Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YME1L1Q96TA2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
YME1L1Q96TA2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms