Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CPXM1Q96SM3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CPXM1Q96SM3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPXM1Q96SM3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms