Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMC6Q96SB8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMC6Q96SB8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms