Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZIM3Q96PE6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZIM3Q96PE6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms