Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RDH12Q96NR8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RDH12Q96NR8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms