Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSNARE1Q96NA8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1Q96NA8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms