Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
JSRP1Q96MG2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
JSRP1Q96MG2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms