Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC114Q96M63 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC114Q96M63 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms