Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERAC1Q96JX3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERAC1Q96JX3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms