Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CHAMP1Q96JM3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHAMP1Q96JM3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms