Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BORCS6Q96GS4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BORCS6Q96GS4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms